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Gene ID Gene Name Tissue Study Parent A Parent B Stage Replicate Replicate Imprinting Status Overall Imprinting Status Imprinting p-value Imprinting Score A x B, A counts A x B, B counts B x A, A counts B x A, B counts % Maternal AxB % Maternal BxA Tot Counts AxB Tot Counts BxA Strain Score Strain p-value Genome Assembly Notes
GRMZM2G053991 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 7.680992 x 10-1 16 7 5 5 69.57% 50.00% 23 10 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.7680992'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.2635524'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053991 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 2.666 x 10-4 70 33 92 47 67.96% 33.81% 103 139 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0002666'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0001352'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053987 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 9.125963 x 10-1 41 42 34 24 49.40% 41.38% 83 58 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.9125963'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.1891613'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053987 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 3.767473 x 10-1 9 7 1 11 56.25% 91.67% 16 12 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.3767473'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0661926'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053958 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 0 6 0 11 0.00% 100.00% 6 11 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.000532'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0190165'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053958 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 6.40775 x 10-2 15 27 9 22 35.71% 70.97% 42 31 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0640775'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0195503'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053946 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 2.3 x 10-10 278 93 222 107 74.93% 32.52% 371 329 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '7.64e-22'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '2.30e-10'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053946 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 4.434343 x 10-1 83 28 38 65 74.77% 63.11% 111 103 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0699742'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.4434343'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053939 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 8.936949 x 10-1 12 8 9 19 60.00% 67.86% 20 28 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.527074'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.8936949'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053939 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 4.912971 x 10-1 13 18 11 8 41.94% 42.11% 31 19 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.3691714'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.4912971'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053934 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 6.695268 x 10-1 131 138 200 178 48.70% 47.09% 269 378 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.6695268'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.2578203'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053934 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 9.059042 x 10-1 96 47 73 125 67.13% 63.13% 143 198 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.9059042'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.2912925'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053927 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 5 1 9 1 83.33% 10.00% 6 10 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.386481'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0001439'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053927 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 2.9852 x 10-3 70 39 67 28 64.22% 29.47% 109 95 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0029852'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.000063'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053925 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 2.05 x 10-4 95 31 56 23 75.40% 29.11% 126 79 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '1.19e-08'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.000205'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053925 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 1.36 x 10-8 74 2 39 12 97.37% 23.53% 76 51 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '1.36e-08'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '6.36e-11'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053921 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 1.052007 x 10-1 63 21 36 46 75.00% 56.10% 84 82 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.1052007'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0423302'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053921 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 5.464936 x 10-1 20 24 36 25 45.45% 40.98% 44 61 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.5464936'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.159011'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053916 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 2.836204 x 10-1 80 67 75 50 54.42% 40.00% 147 125 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.2836204'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0253473'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053916 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 2.972552 x 10-1 103 41 50 83 71.53% 62.41% 144 133 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.2159445'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.2972552'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053909 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 1.828 x 10-4 125 28 112 140 81.70% 55.56% 153 252 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.00008'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0001828'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053909 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 5.049851 x 10-1 20 16 6 27 55.56% 81.82% 36 33 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.5049851'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0002566'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053908 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 5.5836 x 10-3 247 139 174 126 63.99% 42.00% 386 300 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '3.86e-08'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0055836'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053908 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 1.012777 x 10-1 248 57 118 195 81.31% 62.30% 305 313 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '5.78e-08'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.1012777'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053882 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 6.1701 x 10-3 15 0 19 0 100.00% 0.00% 15 19 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0061701'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '7.07e-10'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053882 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 14 0 5 0 100.00% 0.00% 14 5 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0001828'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0253473'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053869 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 4.668543 x 10-1 7 10 4 10 41.18% 71.43% 17 14 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.4668543'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.1088094'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053869 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 0 1 0 1 0.00% 100.00% 1 1 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.1572964'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.4795001'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053833 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 2 1 1 19 66.67% 95.00% 3 20 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.999992'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0071895'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053833 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 0 0 0 2 100.00% 0 2 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: ''
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.1572992'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053831 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 3.070139 x 10-1 52 30 63 75 63.41% 54.35% 82 138 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0151199'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.3070139'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053831 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 7.210191 x 10-1 67 31 45 60 68.37% 57.14% 98 105 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.7210191'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0384339'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053803 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 5.242 x 10-4 800 318 505 670 71.56% 57.02% 1118 1175 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0005242'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '2.32e-12'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053803 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 6.85914 x 10-2 450 397 418 479 53.13% 53.40% 847 897 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0685914'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.041677'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053801 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 3.486 x 10-4 15 42 14 41 26.32% 74.55% 57 55 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0003486'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0002719'
Biased in favor of strain: 'Mo17'
GRMZM2G053801 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 2.059033 x 10-1 6 13 4 16 31.58% 80.00% 19 20 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0011767'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.2059033'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053790 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 7.0379 x 10-3 255 92 152 146 73.49% 48.99% 347 298 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0070379'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '9.68e-11'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053790 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 1.29 x 10-6 336 209 240 145 61.65% 37.66% 545 385 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '5.33e-08'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '1.29e-06'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053781 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 0.0 6425 3501 4435 2995 64.73% 40.31% 9926 7430 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '0'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '0'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053781 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 0.0 21641 7102 9967 12215 75.29% 55.07% 28743 22182 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '0'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '0'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053766 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 1 5 0 13 16.67% 100.00% 6 13 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.1024704'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0003115'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053766 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 1 1 0 5 50.00% 100.00% 2 5 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.6170692'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.1138463'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053764 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 0.0 1628 406 1005 439 80.04% 30.40% 2034 1444 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '1.78e-37'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '0'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053764 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 0.0 663 199 658 243 76.91% 26.97% 862 901 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '0'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '0'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053742 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 6.582534 x 10-1 142 105 89 95 57.49% 51.63% 247 184 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0185599'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.6582534'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053742 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 5.87073 x 10-2 46 46 43 59 50.00% 57.84% 92 102 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0006958'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0587073'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053726 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 1.75 x 10-14 221 225 60 422 49.55% 87.55% 446 482 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '1.75e-14'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '2.32e-22'
Biased in favor of strain: 'Mo17'
GRMZM2G053726 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 8.814974 x 10-1 366 342 362 358 51.69% 49.72% 708 720 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.36707'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.8814974'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053722 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 4.655122 x 10-1 177 191 122 188 48.10% 60.65% 368 310 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.4655122'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0001779'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053722 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 9.112 x 10-4 22 0 10 1 100.00% 9.09% 22 11 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0009112'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.000051'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053720 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 3 0 0 0 100.00% 3 0 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: ''
χ2 p-value for Mo17 x B73: ''
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053720 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 1.1412 x 10-2 27 2 9 1 93.10% 10.00% 29 10 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '3.44e-06'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.011412'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053713 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 9.46707 x 10-2 144 117 125 94 55.17% 42.92% 261 219 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0946707'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.03619'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053713 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 1.09298 x 10-2 170 41 81 112 80.57% 58.03% 211 193 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0000184'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0109298'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053676 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 5.262666 x 10-1 43 18 50 39 70.49% 43.82% 61 89 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.5262666'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '4.83e-06'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053676 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 2.86714 x 10-2 31 16 29 10 65.96% 25.64% 47 39 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0286714'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0023467'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053652 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 1.45 x 10-9 5040 3192 3387 2907 61.22% 46.19% 8232 6294 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '0'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '1.45e-09'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053652 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A paternally biased 1.005 x 10-4 10415 5555 4843 8927 65.22% 64.83% 15970 13770 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0001005'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '4.79e-06'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053631 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 3.010314 x 10-1 31 30 22 57 50.82% 72.15% 61 79 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0086501'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.3010314'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053631 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 2.00095 x 10-2 108 145 115 182 42.69% 61.28% 253 297 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0200095'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0001012'
Biased in favor of strain: 'Mo17'
GRMZM2G053622 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 7 0 11 0 100.00% 0.00% 7 11 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.008151'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0009111'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053622 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 7 0 17 0 100.00% 0.00% 7 17 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0613697'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '5.51e-09'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053610 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 4.76039 x 10-2 140 41 74 110 77.35% 59.78% 181 184 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.002301'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0476039'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053610 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 7.52 x 10-6 341 175 257 165 66.09% 39.10% 516 422 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '2.72e-13'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '7.52e-06'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053588 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 5.838824 x 10-1 90 70 63 57 56.25% 47.50% 160 120 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.1138463'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.5838824'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053588 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 2.0278 x 10-2 47 11 40 49 81.03% 55.06% 58 89 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.020278'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0201497'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053574 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 3 1 1 1 75.00% 50.00% 4 2 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.7236798'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.617075'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053574 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 5 1 3 0 83.33% 0.00% 6 3 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.1024704'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0832645'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053557 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 3.148288 x 10-1 104 90 76 62 53.61% 44.93% 194 138 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.3148288'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.2333557'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053557 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 6.15 x 10-5 123 26 44 37 82.55% 45.68% 149 81 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0000391'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0000615'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053554 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 3.65 x 10-5 80 12 94 55 86.96% 36.91% 92 149 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0000365'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '1.31e-14'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053554 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 5.42 x 10-12 330 160 361 198 67.35% 35.42% 490 559 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '1.59e-14'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '5.42e-12'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053531 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 11 3 4 0 78.57% 0.00% 14 4 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0325094'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0455003'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053531 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 4.503685 x 10-1 31 12 21 12 72.09% 36.36% 43 33 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.4503685'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0002218'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053514 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 1 0 1 0 100.00% 0.00% 1 1 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.4795016'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.1572992'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053514 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 4 3 3 2 57.14% 40.00% 7 5 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.705457'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.6547208'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053511 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 1.0651 x 10-3 192 133 166 103 59.08% 38.29% 325 269 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0010651'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0001224'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053511 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 5.838825 x 10-1 9 3 4 11 75.00% 73.33% 12 15 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.5403009'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.5838825'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053507 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 14 4 1 7 77.78% 87.50% 18 8 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.3173186'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.2112996'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053507 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 7.316006 x 10-1 18 16 9 21 52.94% 70.00% 34 30 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.7316006'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0284597'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053503 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 8.6649 x 10-3 538 260 149 107 67.42% 41.80% 798 256 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '7.49e-23'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.0086649'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053503 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 0.0 1760 453 994 1037 79.53% 51.06% 2213 2031 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '1.02e-37'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '0'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053500 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A paternally biased 4.02 x 10-9 113 120 237 59 48.50% 19.93% 233 296 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '4.02e-09'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '0'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053500 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 5.781 x 10-4 171 113 173 77 60.21% 30.80% 284 250 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0005781'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '1.27e-09'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053466 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 0.0 2348 1451 3026 2161 61.81% 41.66% 3799 5187 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '0'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '3.13e-33'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053466 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 3 0 0 0 100.00% 3 0 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: ''
χ2 p-value for Mo17 x B73: ''
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053458 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 0.0 19057 8013 11541 17714 70.40% 60.55% 27070 29255 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '8.74e-39'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '0'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053458 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 0.0 11382 5977 10059 5839 65.57% 36.73% 17359 15898 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '0'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '0'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053434 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 8.79679 x 10-1 724 544 548 543 57.10% 49.77% 1268 1091 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '4.31e-07'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.879679'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053434 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 7.561787 x 10-1 415 213 176 389 66.08% 68.85% 628 565 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.7561787'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.2710349'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053397 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 6.35 x 10-14 384 78 222 109 83.12% 32.93% 462 331 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '6.35e-14'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '9.40e-39'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053397 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 5.07 x 10-14 786 340 647 403 69.80% 38.38% 1126 1050 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '0'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '5.07e-14'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053338 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 0.0 921 221 473 94 80.65% 16.58% 1142 567 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '0'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '0'
Biased in favor of strain: 'B73'
GRMZM2G053338 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 1.572991 x 10-1 31 5 8 8 86.11% 50.00% 36 16 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0133291'
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Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053322 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 1.572991 x 10-1 30 0 11 11 100.00% 50.00% 30 22 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0001075'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.1572991'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053322 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 8.208472 x 10-1 154 158 174 151 49.36% 46.46% 312 325 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.8208472'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.2020225'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053319 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 4.708417 x 10-1 156 169 108 133 48.00% 55.19% 325 241 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.4708417'
χ2 p-value for Mo17 x B73: '.1073124'
Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053319 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A not imprinted 6.452658 x 10-1 64 47 53 98 57.66% 64.90% 111 151 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0440595'
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Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053315 endosperm Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 13 0 3 0 100.00% 0.00% 13 3 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: '.0107877'
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Biased in favor of strain: ''
GRMZM2G053315 embryo Waters et al. 2011 Z. mays B73 Z. mays Mo17 14 DAP N/A N/A no data 0 0 0 0 0 0 RefGen V2 χ2 p-value for B73 x Mo17: ''
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Biased in favor of strain: ''