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Gene ID Gene Name Tissue Study Parent A Parent B Stage Replicate Replicate Imprinting Status Overall Imprinting Status Imprinting p-value Imprinting Score A x B, A counts A x B, B counts B x A, A counts B x A, B counts % Maternal AxB % Maternal BxA Tot Counts AxB Tot Counts BxA Strain Score Strain p-value Genome Assembly Notes
AT2G10014 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 4 vs 4 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G10014 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G10014 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G10010 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.02'
AT2G10010 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 4 vs 4 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.02'
AT2G10010 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 1 vs 1 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.02'
AT2G10010 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.02'
AT2G10010 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 1 vs 1 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: -.02
AT2G10010 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.02'
AT2G10010 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR 10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.02'
AT2G10010 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 5 vs 5 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.02'
AT2G10010 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.02'
AT2G10000 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.1'
AT2G10000 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR 10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.1'
AT2G10000 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 5 vs 5 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.1'
AT2G10000 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.1'
AT2G10000 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 4 vs 4 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.1'
AT2G10000 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.1'
AT2G10000 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 1 vs 1 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.1'
AT2G10000 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.1'
AT2G10000 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 1 vs 1 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: -.1
AT2G09990 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 1 vs 1 not imprinted not imprinted 1.0 11 7 3 8 61.11% 72.73% 18 11 0.878 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: -.46
AT2G09990 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.46'
AT2G09990 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 5 vs 5 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.46'
AT2G09990 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 not imprinted not imprinted 3.26 x 10-14 1.702 616 112 222 396 84.62% 64.08% 728 618 2.14 1.56 x 10-17 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.46'
AT2G09990 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 maternally biased not imprinted 0.0 4.189 768 63 173 368 92.42% 68.02% 831 541 3.703 3.0 x 10-30 TAIR 10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.46'
AT2G09990 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 1 vs 1 not imprinted not imprinted 0.189 59 45 30 145 56.73% 82.86% 104 175 1.696 1.44 x 10-5 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.46'
AT2G09990 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 4 vs 4 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.46'
AT2G09990 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 not imprinted not imprinted 5.79 x 10-6 1.296 578 59 240 200 90.74% 45.45% 637 440 7.463 0.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.46'
AT2G09990 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 not imprinted not imprinted 0.433 0 3 17 57 0.00% 77.03% 3 74 1.533 0.0368 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.46'
AT2G09970 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 no data no data 0.347 14 0 2 2 100.00% 50.00% 14 4 0.0814 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.84'
AT2G09970 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 4 vs 4 no data no data 1.0 8 0 0 0 100.00% 8 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.84'
AT2G09970 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 1 vs 1 no data no data 1.0 0 0 0 1 100.00% 0 1 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.84'
AT2G09970 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.84'
AT2G09970 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 5 0 0 0 100.00% 5 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.84'
AT2G09970 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 1 vs 1 no data no data 1.0 3 0 4 1 100.00% 20.00% 3 5 0.269 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: -.84
AT2G09970 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 no data no data 1.0 0 0 0 15 100.00% 0 15 1.0 TAIR 10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.84'
AT2G09970 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 5 vs 5 no data no data 1.0 0 0 13 0 0.00% 0 13 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.84'
AT2G09970 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 MEG no data 3.79 x 10-9 6.997 59 0 0 7 100.00% 100.00% 59 7 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: '-.84'
AT2G09960 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09960 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR 10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09960 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 5 vs 5 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09960 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09960 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 4 vs 4 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09960 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09960 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 1 vs 1 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09960 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 1 vs 1 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10
AT2G09960 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09956 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09956 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 1 vs 1 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10
AT2G09956 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 5 vs 5 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09956 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09956 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR 10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09956 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 1 vs 1 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09956 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 4 vs 4 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09956 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09956 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09953 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09953 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 4 vs 4 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09953 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 1 vs 1 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09953 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09953 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 1 vs 1 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10
AT2G09953 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09953 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR 10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09953 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 5 vs 5 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09953 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09950 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR 10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09950 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 5 vs 5 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09950 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Ler A. thaliana Cvi 6 DAP 3 vs 3 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09950 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Ler 6 DAP 4 vs 4 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
AT2G09950 endosperm Pignatta et al. 2014 A. thaliana Col A. thaliana Cvi 6 DAP 2 vs 2 no data no data 1.0 0 0 0 0 0 0 1.0 TAIR10 log2(seedcoat) - log2(endosperm) expression from Belmonte et al. 2013: ''
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